Operation Exodus nos traslada al año 2741, unos 300 años después de lo que vivimos en el juego original. La democrática Alianza de la Estrella Polar ha sido atacada por el Imperio Terran, y el último campo de batalla es el planeta Morningstar Prime, la única posesión que le queda ya a la Alianza.

Si te pones en la piel del capitán Jacob Ángelus y tienes que defenderte del ataque Terrano, ¿qué harías? Prepárate soldado, en la nueva entrega de Ground Control sólo los valientes pueden dirigir a todo un ejército de tierra contra semejante amenaza. ¿Eres tú uno de ellos?.